Szczegóły obiektu: Differentiation of Bacillus anthracis and other Bacillus cereus group bacterial strains using multilocus sequence typing method

Instytucja dostarczająca:Repozytorium Uniwersytetu Łódzkiego

Opis

Tytuł:
Differentiation of Bacillus anthracis and other Bacillus cereus group bacterial strains using multilocus sequence typing method
Twórca:
Graniak, Grzegorz;
Olender, Alina;
Naylor, Katarzyna
Współtwórca:
Graniak, Grzegorz - Military Institute of Hygiene and Epidemiology, Biological Threats Identification and Countermeasure Centre, Lubelska 4, 24-100 Pulawy, Poland;
Olender, Alina - Medical University in Lublin, Department of Medical Microbiology, Chódzki 1, 20-093 Lublin, Poland;
Naylor, Katarzyna - Medical University in Lublin, Department of Didactics and Medical Simulation, Chódzki 4, 20-093 Lublin, Poland;
Graniak, Grzegorz - grzegorz.graniak@gmail.com;
Olender, Alina - grzegorz.graniak@gmail.com;
Naylor, Katarzyna - grzegorz.graniak@gmail.com
Opis:
The study describes the preparation of the phylogenetic differentiation of Bacillus cereus strains. The Bacillus cereus group of bacteria is very important for human and animal health. The multilocus sequence typing scheme has been used to present this group of bacteria’s phylogenetic relationship and structure. The MLST system was established using 60 isolates of B. anthracis, B. cereus sensu stricto, B. thuringiensis, and transitional environment strains of Bacillus spp. As a negative control, five strains of B. subtilis and B. megaterium were used. Primers for amplification and sequencing were designed to target highly conserved internal fragment of seven housekeeping genes: glpF, gmk, ilvD, pta, pur, pycA, and tpi. A total of 22 different sequence types (STs) were distinguished. Analysis of the sequence data showed that all of the Bacillus cereus strains are very closely related. The MLST scheme exhibited a high level of resolution that can be used as an excellent tool for studying the phylogenetic relationship, epidemiology, and population structure of the Bacillus cereus group strains. The MLST method additionally allows us to define the phylogenetic relationship between very closely related strains based on a combination of the sequences of all seven alleles fragments and each of them separately. Thus, this genetic investigation tool is very useful in epidemiological investigation of potential military/ bioterrorist use of B. anthracis.
Dostępność obiektu:
Dostęp otwarty
Prawa: https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0
Data:
2021.08.27;
2020.12.30
Typ:
Article
Język:
angielski
Format:
application/pdf
Wydawca:
Wydawnictwo Uniwersytetu Łódzkiego
Relacja:
Acta Universitatis Lodziensis. Folia Biologica et Oecologica;
16
Temat i słowa kluczowe:
Bacillus cereus group;
multilocus sequence typing;
sequencing;
housekeeping genes;
phylogenetic differentiation;
BioNumerics
Identyfikator:
1730-2366;
http://hdl.handle.net/11089/38848 ;
2083-8484;
10.18778/1730-2366.16.02
Dostawca danych:
Repozytorium Uniwersytetu Łódzkiego

Podobne obiekty

Differentiation of Bacillus anthracis and other Bacillus cereus group bacterial strains using multilocus sequence typing method

Twórca:Graniak, Grzegorz | Olender, Alina | Naylor, Katarzyna

Data:2021.08.27 | 2020.12.30

Rodzaj zawartości:obrazy

Allozyme variation and differentiation in Chionomys nivalis (Martins, 1842)

Twórca:Filippucci, M. G. | Fadda, V. | Kryśtufek, B. | Simson, S. | Amori, G.

Data:1991.12.31 | 1991

Rodzaj zawartości:pozostałe

The Barrage in reading and writing

Twórca:Pellegrini, Sara

Data:2018.06.27

Rodzaj zawartości:teksty

Characterization of the Uterine Microbiome in Endometrial Cancer Patients and Identification of the genus Anaerococcus as a Potential Indicator of EC and a Possible Carcinogenic Cofactor. SONATA-17 2021/43/D/NZ7/01386 (dataset)

Twórca:Kowalczyk, Aleksandra | Kuźmycz, Olga | Lach, Jakub

Data:2024.07.31 | 2024

Rodzaj zawartości:teksty

Badanie poczucia subiektywnego związanego z dzieleniem na sylaby wyrazów języka polskiego – podział wieloelementowych grup spółgłoskowych

Twórca:Śledziński, Daniel

Data:2018.01.29

Rodzaj zawartości:teksty

Modern use of modified Sequencing Batch Reactor in wastewater Treatment

Twórca:Khan, Afzal Hussain | Rudayni, Hassan Ahmad | Chaudhary, Anis Ahmad | Imran, Mohd | Vambol, Sergij

Data:2022.07.11

Rodzaj zawartości:teksty

Evaluation of analytical protocols of alignment mapping tools using high throughput next-generation genome sequencing data

Twórca:Bąk, Artur | Bodziony, Dawid | Migdałek, Grzegorz | Pareek, Chandra Shekhar | Żukowski, Kacper

Data:2021.01.23

Rodzaj zawartości:teksty

Skin Microbiome in Prurigo Nodularis

Data:2023.10.27 | 2023

Rodzaj zawartości:obrazy

Federacja Bibliotek Cyfrowych

Szczegóły obiektu: Differentiation of Bacillus anthracis and other Bacillus cereus group bacterial strains using multilocus sequence typing method

Opis

Podobne obiekty