Opis

• Tytuł:
  Nanocząstki polistyrenowe i ich właściwości epigenetyczne i genotoksyczne w ludzkich jednojądrzastych komórkach krwi obwodowej - PRELUDIUM-20 nr 2021/41/N/NZ7/02049 (dataset)
• Twórca:
  Malinowska, Kinga
• Współtwórca:
  Uniwersytet Łódzki, Wydział Biologii i Ochrony Środowiska. Katedra Biofizyki Skażeń Środowiska;
  kinga.malinowska@edu.uni.lodz.pl
• Opis:
  Opis plików: (1) Plik MS Excel z wynikami oraz plik pdf z przykładowymi chromatogramami z badań poziomu 5 metdC w ludzkich PBMC traktowanych NP-PS z wykorzystaniem precyzyjnej metody chromatograficznej z detekcją mas 2D-UPLC-MS/M (2) Plik MS Excel z wynikami oraz plik pdf z przykładowymi chromatogramami z badań poziomu 5 hmdC w ludzkich PBMC traktowanych NP-PS z wykorzystaniem precyzyjnej metody chromatograficznej z detekcją mas 2D-UPLC-MS/M (3) Plik MS Excel z wynikami oraz plik pdf z przykładowymi chromatogramami z badań poziomu dU w ludzkich PBMC traktowanych NP-PS z wykorzystaniem precyzyjnej metody chromatograficznej z detekcją mas 2D-UPLC-MS/M (4) Plik MS Excel z wynikami oraz plik pdf z przykładowymi chromatogramami z badań poziomu 5 hmdU w ludzkich PBMC traktowanych NP-PS z wykorzystaniem precyzyjnej metody chromatograficznej z detekcją mas 2D-UPLC-MS/M (5) Plik MS Excel z wynikami z badań metylacji genu supresorowego TP53 w ludzkich PBMC narażonych na NP-PS za pomocą metody Real-Time PCR (6) Plik MS Excel z wynikami z badań metylacji genu supresorowego CDKN2A w ludzkich PBMC narażonych na NP-PS za pomocą metody Real-Time PCR (7) Plik MS Excel z wynikami z badań metylacji genu supresorowego CDKN1A w ludzkich PBMC narażonych na NP-PS za pomocą metody Real-Time PCR (8) Plik MS Excel z wynikami z badań metylacji protoonkogenu CCND1 w ludzkich PBMC narażonych na NP-PS za pomocą metody Real-Time PCR (9) Plik MS Excel z wynikami z badań metylacji protoonkogenu BCL2 w ludzkich PBMC narażonych na NP-PS za pomocą metody Real-Time PCR (10) Plik MS Excel z wynikami z badań metylacji protoonkogenu BCL6 w ludzkich PBMC narażonych na NP-PS za pomocą metody Real-Time PCR (11) Plik MS Excel z wynikami z badań ekspresjii genu supresorowego TP53 w ludzkich PBMC narażonych na NP-PS za pomocą metody Real-Time PCR (12) Plik MS Excel z wynikami z badań ekspresjii genu supresorowego CDKN1A w ludzkich PBMC narażonych na NP-PS za pomocą metody Real-Time PCR (13) Plik MS Excel z wynikami z badań ekspresjii genu supresorowego CDKN2A w ludzkich PBMC narażonych na NP-PS za pomocą metody Real-Time PCR (14) Plik MS Excel z wynikami z badań ekspresjii protoonkogenu CCND1 w ludzkich PBMC narażonych na NP-PS za pomocą metody Real-Time PCR (15) Plik MS Excel z wynikami z badań ekspresji protoonkogenu BCL2 w ludzkich PBMC narażonych na NP-PS za pomocą metody Real-Time PCR (16) Plik MS Excel z wynikami z badań ekspresji protoonkogenu BCL6 w ludzkich PBMC narażonych na NP-PS za pomocą metody Real-Time PCR.;
  Celem kolejnej części projektu było określenie wpływu krótkotrwałej ekspozycji niefunkcjonalizowanych nanocząstek polistyrenowych (PS-NP) o różnych średnicach 29, 44 i 72 nm na metylację DNA i ekspresję genów w jednojądrzastych komórkach krwi obwodowej człowieka (PBMC) in vitro. Komórki inkubowano z PS-NP w zakresie stężeń od 0,001 do 100 µg/ml przez 24 godziny. W pierwszym etapie przeprowadzona analiza obejmowała: całkowitą metylację DNA, metylację regionów promotorowych wybranych genów supresorowych (P16 (CDKN2A), P53 (TP53) i P21 (CDKN1A)) i protoonkogenów (CCND1, BCL2, BCL6) oraz profil ekspresji wskazanych genów za pomocą metody Real-Time PCR. Ponadto analiza z wykorzystaniem precyzyjnej metody chromatograficznej z detekcją mas 2D-UPLC-MS/MS pozwoliła na ocenę poziomu 5-metylo-2′-deoksycytydyny (5-mdC) i 5-(hydroksymetylo)-2′-deoksycytydyny (5-hmdC), a także poziomu 2′-deoksyurydyny (dU) i 5-(hydroksymetylo)-2′-deoksyurydyny (5-hmdU).;
  The aim of the next part of the project was to determine the impact of short-term exposure non-functionalized polystyrene nanoparticles (PS-NP) of different diameters (29, 44, and 72 nm) on DNA methylation and gene expression in human peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) in vitro. PBMCs were exposed to PS-NPs at concentrations ranging from 0.001 to 100 µg/mL for 24 h period. In the first stage the analysis encompassed epigenetic DNA modifications, including levels of 5-methyl-2′-deoxycytidine (5-mdC) and 5-(hydroxymethyl)-2′-deoxycytidine (5-hmdC), as well as the levels of 2′-deoxyuridine (dU) and 5-(hydroxymethyl)-2′-deoxyuridine (5-hmdU) by mass spectrometry methods, methylation in the promoter regions of selected tumor suppressor genes TP53 (P53), CDKN2A (P16), and CDKN1A (P21) and proto-oncogenes (CCND1, BCL2, BCL6), along with the expression profile of the indicated genes by real-time PCR assays.;
  Narodowe Centrum Nauki (NCN), grant Preludium 20 nr 2021/41/N/NZ7/02049
• Dostępność obiektu:
  Dostęp otwarty
• Prawa:
  Uznanie autorstwa 4.0 Międzynarodowe;
  http://creativecommons.org/licenses/by/4.0
• Data:
  2025.03.19;
  2024
• Typ:
  Dataset
• Język:
  polski
• Format:
  application/octet-stream;
  application/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheet
• Temat i słowa kluczowe:
  polystyrene nanoparticles;
  peripheral blood mononuclear cells;
  epigenetic DNA modifications;
  suppressor genes;
  proto-oncogenes
• Identyfikator: http://hdl.handle.net/11089/55037
• Dostawca danych:
  Repozytorium Uniwersytetu Łódzkiego
• Czy mogę z tego obiektu skorzystać?:
  sprawdź warunki licencji
• Rodzaj zawartości:
  teksty