Object's details: Nanocząstki polistyrenowe i ich właściwości epigenetyczne i genotoksyczne w ludzkich jednojądrzastych komórkach krwi obwodowej - PRELUDIUM-20 nr 2021/41/N/NZ7/02049 (dataset)

Provider:Repozytorium Uniwersytetu Łódzkiego

Description

Title:
Nanocząstki polistyrenowe i ich właściwości epigenetyczne i genotoksyczne w ludzkich jednojądrzastych komórkach krwi obwodowej - PRELUDIUM-20 nr 2021/41/N/NZ7/02049 (dataset)
Creator:
Malinowska, Kinga
Contributor:
Uniwersytet Łódzki, Wydział Biologii i Ochrony Środowiska. Katedra Biofizyki Skażeń Środowiska;
kinga.malinowska@edu.uni.lodz.pl
Description:
Opis plików: (1) Plik MS Excel z wynikami oraz plik pdf z przykładowymi chromatogramami z badań poziomu 5 metdC w ludzkich PBMC traktowanych NP-PS z wykorzystaniem precyzyjnej metody chromatograficznej z detekcją mas 2D-UPLC-MS/M (2) Plik MS Excel z wynikami oraz plik pdf z przykładowymi chromatogramami z badań poziomu 5 hmdC w ludzkich PBMC traktowanych NP-PS z wykorzystaniem precyzyjnej metody chromatograficznej z detekcją mas 2D-UPLC-MS/M (3) Plik MS Excel z wynikami oraz plik pdf z przykładowymi chromatogramami z badań poziomu dU w ludzkich PBMC traktowanych NP-PS z wykorzystaniem precyzyjnej metody chromatograficznej z detekcją mas 2D-UPLC-MS/M (4) Plik MS Excel z wynikami oraz plik pdf z przykładowymi chromatogramami z badań poziomu 5 hmdU w ludzkich PBMC traktowanych NP-PS z wykorzystaniem precyzyjnej metody chromatograficznej z detekcją mas 2D-UPLC-MS/M (5) Plik MS Excel z wynikami z badań metylacji genu supresorowego TP53 w ludzkich PBMC narażonych na NP-PS za pomocą metody Real-Time PCR (6) Plik MS Excel z wynikami z badań metylacji genu supresorowego CDKN2A w ludzkich PBMC narażonych na NP-PS za pomocą metody Real-Time PCR (7) Plik MS Excel z wynikami z badań metylacji genu supresorowego CDKN1A w ludzkich PBMC narażonych na NP-PS za pomocą metody Real-Time PCR (8) Plik MS Excel z wynikami z badań metylacji protoonkogenu CCND1 w ludzkich PBMC narażonych na NP-PS za pomocą metody Real-Time PCR (9) Plik MS Excel z wynikami z badań metylacji protoonkogenu BCL2 w ludzkich PBMC narażonych na NP-PS za pomocą metody Real-Time PCR (10) Plik MS Excel z wynikami z badań metylacji protoonkogenu BCL6 w ludzkich PBMC narażonych na NP-PS za pomocą metody Real-Time PCR (11) Plik MS Excel z wynikami z badań ekspresjii genu supresorowego TP53 w ludzkich PBMC narażonych na NP-PS za pomocą metody Real-Time PCR (12) Plik MS Excel z wynikami z badań ekspresjii genu supresorowego CDKN1A w ludzkich PBMC narażonych na NP-PS za pomocą metody Real-Time PCR (13) Plik MS Excel z wynikami z badań ekspresjii genu supresorowego CDKN2A w ludzkich PBMC narażonych na NP-PS za pomocą metody Real-Time PCR (14) Plik MS Excel z wynikami z badań ekspresjii protoonkogenu CCND1 w ludzkich PBMC narażonych na NP-PS za pomocą metody Real-Time PCR (15) Plik MS Excel z wynikami z badań ekspresji protoonkogenu BCL2 w ludzkich PBMC narażonych na NP-PS za pomocą metody Real-Time PCR (16) Plik MS Excel z wynikami z badań ekspresji protoonkogenu BCL6 w ludzkich PBMC narażonych na NP-PS za pomocą metody Real-Time PCR.;
Celem kolejnej części projektu było określenie wpływu krótkotrwałej ekspozycji niefunkcjonalizowanych nanocząstek polistyrenowych (PS-NP) o różnych średnicach 29, 44 i 72 nm na metylację DNA i ekspresję genów w jednojądrzastych komórkach krwi obwodowej człowieka (PBMC) in vitro. Komórki inkubowano z PS-NP w zakresie stężeń od 0,001 do 100 µg/ml przez 24 godziny. W pierwszym etapie przeprowadzona analiza obejmowała: całkowitą metylację DNA, metylację regionów promotorowych wybranych genów supresorowych (P16 (CDKN2A), P53 (TP53) i P21 (CDKN1A)) i protoonkogenów (CCND1, BCL2, BCL6) oraz profil ekspresji wskazanych genów za pomocą metody Real-Time PCR. Ponadto analiza z wykorzystaniem precyzyjnej metody chromatograficznej z detekcją mas 2D-UPLC-MS/MS pozwoliła na ocenę poziomu 5-metylo-2′-deoksycytydyny (5-mdC) i 5-(hydroksymetylo)-2′-deoksycytydyny (5-hmdC), a także poziomu 2′-deoksyurydyny (dU) i 5-(hydroksymetylo)-2′-deoksyurydyny (5-hmdU).;
The aim of the next part of the project was to determine the impact of short-term exposure non-functionalized polystyrene nanoparticles (PS-NP) of different diameters (29, 44, and 72 nm) on DNA methylation and gene expression in human peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) in vitro. PBMCs were exposed to PS-NPs at concentrations ranging from 0.001 to 100 µg/mL for 24 h period. In the first stage the analysis encompassed epigenetic DNA modifications, including levels of 5-methyl-2′-deoxycytidine (5-mdC) and 5-(hydroxymethyl)-2′-deoxycytidine (5-hmdC), as well as the levels of 2′-deoxyuridine (dU) and 5-(hydroxymethyl)-2′-deoxyuridine (5-hmdU) by mass spectrometry methods, methylation in the promoter regions of selected tumor suppressor genes TP53 (P53), CDKN2A (P16), and CDKN1A (P21) and proto-oncogenes (CCND1, BCL2, BCL6), along with the expression profile of the indicated genes by real-time PCR assays.;
Narodowe Centrum Nauki (NCN), grant Preludium 20 nr 2021/41/N/NZ7/02049
Object availability:
free access
Rights:
Uznanie autorstwa 4.0 Międzynarodowe;
http://creativecommons.org/licenses/by/4.0
Date:
2025.03.19;
2024
Type:
Dataset
Language:
Polish
Format:
application/octet-stream;
application/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheet
Subject:
polystyrene nanoparticles;
peripheral blood mononuclear cells;
epigenetic DNA modifications;
suppressor genes;
proto-oncogenes
Identifier: http://hdl.handle.net/11089/55037
Data provider:
Repozytorium Uniwersytetu Łódzkiego

Similar objects

Nanocząstki polistyrenowe i ich właściwości epigenetyczne i genotoksyczne w ludzkich jednojądrzastych komórkach krwi obwodowej - PRELUDIUM-20 nr 2021/41/N/NZ7/02049 (dataset)

Creator:Malinowska, Kinga

Date:2025.03.19 | 2024

Type:text

Nanocząstki polistyrenowe i ich właściwości epigenetyczne i genotoksyczne w ludzkich jednojądrzastych komórkach krwi obwodowej - PRELUDIUM-20 nr 2021/41/N/NZ7/02049 (dataset)

Creator:Malinowska, Kinga

Date:2023.11.22 | 2022

Type:text

Impact of Short-Term Exposure to Non-Functionalized Polystyrene Nanoparticles on DNA Methylation and Gene Expression in Human Peripheral Blood Mononuclear Cells

Date:2025.03.10 | 2024.11.28

Type:image

Polystyrene nanoparticles: the mechanism of their genotoxicity in human peripheral blood mononuclear cells

Date:2023.11.22 | 2022

Type:image

Dataset to project MINIATURA7 funded by the National Science Centre, Poland (grant number 2023/07/X/ST5/01519)

Creator:Kisielewska, Aneta | Kruk, Andrzej | Krzywiecki, Maciej | Dudek, Mariusz

Date:2025.03.20 | 2024

Type:text

Effect of suberoylanilide hydroxamic acid on peripheral blood mononuclear cell cytotoxicity towards tumor cells in canines

Creator:Oyamada, T. | Okano, S.

Date:2021.03.28

Type:image

Ocena właściwości prooksydacyjnych, genotoksycznych i proapoptotycznych nanocząstek polistyrenu w jednojądrzastych komórkach krwi obwodowej człowieka

Creator:Malinowska, Kinga

Date:2023.09.19 | 2023 | 2023.11.06

Type:text

The influence of hepatocyte growth factor on the proliferation and differentiation of stem cells

Date:2025.01.08

Type:text

Federacja Bibliotek Cyfrowych

Object's details: Nanocząstki polistyrenowe i ich właściwości epigenetyczne i genotoksyczne w ludzkich jednojądrzastych komórkach krwi obwodowej - PRELUDIUM-20 nr 2021/41/N/NZ7/02049 (dataset)

Description

Similar objects