Szczegóły obiektu: A Protein Data Bank Survey Reveals Shortening of Intermolecular Hydrogen Bonds in Ligand-Protein Complexes When a Halogenated Ligand Is an H-Bond Donor.

Instytucja dostarczająca:Repozytorium Instytutu Biochemii i Biofizyki Polskiej Akademii Nauk

Opis

Tytuł:
A Protein Data Bank Survey Reveals Shortening of Intermolecular Hydrogen Bonds in Ligand-Protein Complexes When a Halogenated Ligand Is an H-Bond Donor.
Twórca:
Poznański, Jarosław;
Poznańska, Anna;
Shugar, David
Opis:
Halogen bonding in ligand-protein complexes is currently widely exploited, e.g. in drug design or supramolecular chemistry. But little attention has been directed to other effects that may result from replacement of a hydrogen by a strongly electronegative halogen. Analysis of almost 30000 hydrogen bonds between protein and ligand demonstrates that the length of a hydrogen bond depends on the type of donor-acceptor pair. Interestingly, lengths of hydrogen bonds between a protein and a halogenated ligand are visibly shorter than those estimated for the same family of proteins in complexes with non-halogenated ligands. Taking into account the effect of halogenation on hydrogen bonding is thus important when evaluating structural and/or energetic parameters of ligand-protein complexes. All these observations are consistent with the concept that halogenation increases the acidity of the proximal amino/imino/hydroxyl groups and thus makes them better, i.e. stronger, H-bond donors.
Dostępność obiektu:
Dostęp otwarty
Data:
2014.06.16
Typ:
Article;
PeerReviewed
Język:
angielski
Format:
application/pdf
Relacja: http://eprints.ibb.waw.pl/715 ;http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0099984
Temat i słowa kluczowe:
Q Science (General);
QC Physics
Identyfikator: http://eprints.ibb.waw.pl/715/1/jp2014_PLoS_journal.pone.0099984.pdf ;
Poznański, Jarosław and Poznańska, Anna and Shugar, David (2014) A Protein Data Bank Survey Reveals Shortening of Intermolecular Hydrogen Bonds in Ligand-Protein Complexes When a Halogenated Ligand Is an H-Bond Donor. PloS one, 9 (6). e99984. ISSN 1932-6203
Dostawca danych:
Repozytorium Instytutu Biochemii i Biofizyki Polskiej Akademii Nauk

Podobne obiekty

A Protein Data Bank Survey Reveals Shortening of Intermolecular Hydrogen Bonds in Ligand-Protein Complexes When a Halogenated Ligand Is an H-Bond Donor.

Twórca:Poznański, Jarosław | Poznańska, Anna | Shugar, David

Data:2014.06.16

Rodzaj zawartości:pozostałe

The TFE-induced transient native-like structure of the intrinsically disordered [Formula: see text] domain of Escherichia coli RNA polymerase.

Data:2014.12

Rodzaj zawartości:pozostałe

Non-specific clustering of histidine tagged green fluorescent protein mediated by surface interactions: the collective effect in the protein-adsorption behaviour

Twórca:Sobieściak, Tomasz D. | Zielenkiewicz, Piotr

Data:2013

Rodzaj zawartości:pozostałe

Halogen bonds involved in binding of halogenated ligands by protein kinases.

Twórca:Poznański, Jarosław | Winiewska, Maria | Czapinska, Honorata | Poznańska, Anna | Shugar, David

Data:2016

Rodzaj zawartości:pozostałe

Halogen bonding at the ATP binding site of protein kinases: preferred geometry and topology of ligand binding.

Twórca:Poznański, Jarosław | Shugar, David

Data:2013.07

Rodzaj zawartości:pozostałe

Thermodynamics parameters for binding of halogenated benzotriazole inhibitors of human protein kinase CK2α.

Twórca:Winiewska, Maria | Kucińska, Katarzyna | Makowska, Małgorzata | Poznański, Jarosław | Shugar, David

Data:2015.10

Rodzaj zawartości:pozostałe

Isomeric Mono-, Di-, and Tri-Bromobenzo-1H-Triazoles as Inhibitors of Human Protein Kinase CK2α.

Twórca:Wąsik, Romualda | Wińska, Patrycja | Poznański, Jarosław | Shugar, David

Data:2012

Rodzaj zawartości:pozostałe

Contribution of a halogen bond to binding of halogenated ligands by protein kinases (Rola wiązania halogenowego w oddziaływaniu halogenowanych ligandów z kinazami białkowymi)

Twórca:Poznański, Jarosław

Data:2015

Rodzaj zawartości:pozostałe

Federacja Bibliotek Cyfrowych

Szczegóły obiektu: A Protein Data Bank Survey Reveals Shortening of Intermolecular Hydrogen Bonds in Ligand-Protein Complexes When a Halogenated Ligand Is an H-Bond Donor.

Opis

Podobne obiekty