Object's details: Enzymy zaangażowane w dojrzewanie 3’ końca tRNA u mykobakterii

Provider:Repozytorium Uniwersytetu Łódzkiego

Description

Title:
Enzymy zaangażowane w dojrzewanie 3’ końca tRNA u mykobakterii
Creator:
Lechowicz, Ewelina
Contributor:
Instytut Biologii Medycznej Polskiej Akademii Nauk w Łodzi;
ewelina.lechowicz@edu.uni.lodz.pl
Description:
Ponad połowa tRNA Mycobacterium tuberculosis wymaga dodania terminalnej sekwencji cytozyna-cytozyna-adenina. Proteom mykobakterii musi zatem posiadać enzym o aktywności nukleotydylotransferazy tRNA (dodający CCA). Dojrzewanie 3’ końca tRNA u bakterii odbywa się miedzy innymi przy udziale egzonukleaz z nadrodziny DnaQ. Celem pracy była identyfikacja oraz charakterystyka enzymów uczestniczących w procesie dojrzewania 3’ końca cząsteczek tRNA u mykobakterii. Pierwszy etap pracy obejmował identyfikację enzymu o aktywności nukleotydyloytransferazy tRNA w proteomie mykobakterii. Skonstruowano rekombinowane szczepy M. smegmatis oraz M. tuberculosis charakteryzujące się obniżonym poziomem potencjalnych enzymów CCAMtb oraz CCAMsm. Analiza RNA Seq wykazała akumulację 18 (z 45) rodzajów tRNA. Niedojrzałe cząsteczki tRNA, były silnie poliadenylowane. W celu zbadania czy za zjawisko poliadenylacji transkryptów przy niedoborach enzymu CCAMtb u mykobakterii odpowiada PNPaza, przygotowano szczep o obniżonej ekspresji dwóch genów, ccaMtbCas9 oraz gps1MtbCas9. Analizy RNAseq, wykazały, że zjawisko poliadenylacji transkryptów obserwowane jest wyłącznie dla szczepu o obniżonym poziomie enzymu CCAMtb, w obecności niezaburzonej ekspresji genu gps1. Kolejnym etapem pracy było poznanie funkcji egzonukleaz zaangażowanych w dojrzewanie 3’ końca tRNA u mykobakterii. W tym celu skonstruowano szereg mutantów M. smegmatis pozbawionych funkcjonalnych genów kodujących rnPH, rnT, rnZ1, rnZ2, rnD, oraz oczyszczono rekombinowane białka. Analiza transkryptomiczna wykazała, że w przypadku deplecji RNaz PH i T dochodzi do nadprodukcji wielu rodzajów tRNA w komórkach prątków. Wyniki dowodzą, że Rv3907c pełni u mykobakterii niezbędną funkcję nukleotydylotransferazy tRNA i może być rozpatrywany jako atrakcyjne miejsce docelowe dla nowych tuberkulostatyków. Wykazano, że PNPaza jest odpowiedzialna za poliadenylację transkryptów. Analiza mutantów pozbawionych egzonukleaz wskazała na istotną rolę RNazy T w procesie dojrzewania tRNA.;
Grant NCN: Enzymy metabolizmu RNA, PAP I i PNPaza, jako miejsca docelowe dla nowych leków przeciwprątkowych i ich funkcjonalna charakterystyka. 2017/25/B/NZ7/01290
Object availability:
free access
Rights: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0 ;
Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 Międzynarodowe
Date:
2023.10.23;
2023;
2023.12.18
Type:
PhD/Doctoral Dissertation
Language:
Polish
Format:
application/pdf
Subject:
Mycobacterium tuberculosis;
tRNA;
gruźlica
Identifier: http://hdl.handle.net/11089/48112
Data provider:
Repozytorium Uniwersytetu Łódzkiego

Similar objects

Enzymy zaangażowane w dojrzewanie 3’ końca tRNA u mykobakterii

Creator:Lechowicz, Ewelina

Date:2023.10.23 | 2023 | 2023.12.18

Type:text

The effect of cadmium and barium on aminoacyl-tRNA synthetases activity in rats liver

Creator:Pasternak, Kazimierz

Date:1998

Type:other

tRNA of the Fungus Pleurotus ostreatus. Preparation and Purification by the Method of Preparative Gel Electrophoresis

Creator:Nowak, Grzegorz | Leonowicz, Andrzej (1933-2011) | Trojanowski, Jerzy (1925-2013)

Date:1975

Type:image

Profil odpowiedzi cytokinowej na antygeny mykobakterii oraz ekspresja receptorów przekazywania sygnałów w aktywnej gruźlicy i latentnym zakażeniu Mycobacterium tuberculosis

Creator:Włodarczyk, Marcin

Date:2015.01.27 | 2015

Type:text

Interakcja Mycobacterium tuberculosis z ludzkim surowiczym amyloidem A

Creator:Kawka, Malwina Irena

Date:2021.03.04 | 2021 | 2021.06.01

Type:text

Genetic methods used in detection and strain differentiation of the bacteria belonging to the Mycobacterium tuberculosis complex for diagnosis and epidemiology

Creator:Chocholska, Sylwia | Krawczyk, Paweł (medycyna ; immunologia) | Adamczyk-Korbel, Marta | Milanowski, Janusz

Date:2002

Type:image

Analiza funkcjonalna wybranych, „sierocych” białek regulatorowych dwukomponentowych systemów transdukcji sygnału u mykobakterii

Creator:Antczak, Magdalena

Date:2018.10.05 | 2018 | 2019.01.15

Type:text

The Evolution of Diagnostic Techniques in the Paleopathology of Tuberculosis: A Scoping Review

Creator:Papa, Veronica | Galassi, Franceso M. | Varotto, Elena | Gori, Andrea | Vaccarezza, Mauro

Date:2023.10.27 | 2023

Type:image

Federacja Bibliotek Cyfrowych

Object's details: Enzymy zaangażowane w dojrzewanie 3’ końca tRNA u mykobakterii

Description

Similar objects