Description

• Title:
  Charakterystyka bioróżnorodności i potencjału biotechnologicznego mikroorganizmów halofilnych
• Creator:
  Lach, Jakub
• Contributor:
  Uniwersytet Łódzki, Wydział Biologii i Ochrony Środowiska, Katedra Mikrobiologii Molekularnej
• Description:
  Celem przedstawionej pracy doktorskiej było scharakteryzowanie bioróżnorodności mikrobiomów wybranych środowisk o wysokim zasoleniu oraz ocena potencjału biotechnologicznego bytujących w nich mikroorganizmów w oparciu o dane genomiczne i metagenomiczne. Wygenerowane dane oraz przeprowadzone analizy pozwoliły na ocenę składu taksonomicznego mikrobiomu Kopalni Soli Bochnia oraz na identyfikację klastrów genów związanych z biosyntezą wtórnych metabolitów. Ponadto w analizowanych metagenomach zidentyfikowano 16 unikatowych MAGs, z których 15 nie ma swoich odpowiedników wśród dotychczas znanych sekwencji. W toku analiz zsekwencjonowano również genomy pięciu szczepów Eubakterii oraz trzech szczepów Archaea wyizolowanych z solanek pobranych na obszarze Przedgórza Karpackiego. Część z genomów należy najprawdopodobniej do nowych, nieopisanych dotychczas gatunków. W dalszej kolejności na podstawie danych metagenomicznych wytypowano trzy sekwencje, które potencjalnie mogły kodować peptydy przeciwdrobnoustrojowe. Zostały one zsyntezowane a ich właściwości zostały ocenione w warunkach laboratoryjnych. Wykazano, że peptyd P1 był aktywny przeciw E. faecalis 29212 a peptyd P3 przeciw E. faecalis 29212 i S. aureus 43300. Ponadto udowodniono, że oba analizowane peptydy nie mają właściwości cytotoksycznych ani nie wykazują aktywności hemolitycznej. Podsumowując, w toku prac scharakteryzowano mikrobiom Kopalni Soli Bochnia oraz genomy szczepów mikroorganizmów wyizolowanych z solanek pobranych na obszarze Przedgórza Karpackiego. Ponadto wykazano, że wybrane peptydy kodowane w analizowanych metagenomach wykazują aktywność przeciwdrobnoustrojową i mogą być obiektem dalszych badań mających na celu ocenę możliwości wykorzystania ich w praktyce.;
  "InterDOC-STARt – Interdyscyplinarne Studia Doktoranckie na Wydziale BiOŚ UŁ” - Program Operacyjny Wiedza Edukacja Rozwój 2014-2020, Oś priorytetowa III. Szkolnictwo wyższe dla gospodarki i rozwoju, Działanie 3.2 Studia doktoranckie. Nr projektu: POWR.03.02.00- IP.08-00-DOK/16. Realizowany w latach 2018-2022. Kierownik – prof. dr hab. Agnieszka Marczak.
• Object availability:
  free access
• Rights: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0 ;
  Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 Międzynarodowe
• Date:
  2023.09.06;
  2023;
  2023.11.07
• Type:
  PhD/Doctoral Dissertation
• Language:
  Polish
• Format:
  application/pdf
• Subject:
  Metagenomika;
  Halofile;
  Mikrobiologia środowiskowa
• Identifier: http://hdl.handle.net/11089/47858
• Data provider:
  Repozytorium Uniwersytetu Łódzkiego
• Can I use it?:
  seek permission
• Type:
  text