Szczegóły obiektu: Multi-conformer molecules in solutions: an NMR-based DFT/MP2 conformational study of two glucopyranosides of a vitamin E model compound

Instytucja dostarczająca:Repozytorium Uniwersytetu Łódzkiego

Opis

Tytuł:
Multi-conformer molecules in solutions: an NMR-based DFT/MP2 conformational study of two glucopyranosides of a vitamin E model compound
Twórca:
Nazarski, Ryszard Bolesław;
Wałejko, Piotr;
Witkowski, Stanisław
Współtwórca:
University of Łódź, Faculty of Chemistry, Department of Theoretical and Structural Chemistry;
University of Białystok, Institute of Chemistry;
nazarski@uni.lodz.pl
Opis:
Overall conformations of both anomeric per-O-acetylated glucosyl derivatives of 2,2,5,7,8-pentamethylchroman- 6-ol were studied in the context of their high flexibility, on the basis of NMR spectra in CDCl3 solution and related DFT calculation results. A few computational protocols were used, including diverse density functional/basis set combinations with a special emphasis on accounting (at various steps of the study) for the impact of intramolecular London-dispersion (LD) effects on geometries and relative Gibbs free energies (ΔGs) of different conformers coexisting in solution. The solvent effect was simulated by an IEF-PCM approach with the UFF radii; its other variants, including the use of the recently introduced IDSCRF radii, were employed for a few compact B3LYP-GD3BJ optimized structures showing one small imaginary vibrational frequency. The advantage of using IDSCRF radii for such purposes was shown. Of the four tested DFT methods, only the application of the B3LYP/6-31+G(d,p) approximation afforded ensembles of 7–8 single forms for which population-average values of computed NMR parameters (δH, δC and some nJHH data) were in close agreement with those measured experimentally; binuclear (δH,C 1 : 1) correlations, rH,C 2 = 0.9998. The associated individual ΔG values, corrected for LD interactions by applying Grimme’s DFT-D3 terms, afforded relative contents of different contributors to the analyzed conformational families in much better agreement with pertinent DFT/NMR-derived populations (i.e., both data sets were found to be practically equal within the limits of estimated errors) than those calculated from dispersion uncorrected ΔGs. All these main findings were confirmed by additional results obtained at the MP2 level of theory. Various other aspects of the study such as the crystal vs. solution structure, gg/gt rotamer ratio, diagnostic (de)shielding effects, dihydrogen C–H⋯H–C contacts, and doubtful applicability of some specialized DFT functionals (M06-2X, ωB97X-D and B3LYP-GD3BJ) for the description of highly flexible molecules are also discussed in detail.
Dostępność obiektu:
Dostęp otwarty
Prawa: http://creativecommons.org/licenses/by-nc/3.0/pl ;
Uznanie autorstwa-Użycie niekomercyjne 3.0 Polska
Data:
2016.12.14;
2016
Typ:
Article
Język:
angielski
Format:
application/pdf
Wydawca:
The Royal Society of Chemistry
Relacja:
Organic & Biomolecular Chemistry;14
Identyfikator:
1477-0520;
1477-0539;
http://hdl.handle.net/11089/20203 ;
10.1039/c5ob01865j
Dostawca danych:
Repozytorium Uniwersytetu Łódzkiego

Podobne obiekty

Multi-conformer molecules in solutions: an NMR-based DFT/MP2 conformational study of two glucopyranosides of a vitamin E model compound

Twórca:Nazarski, Ryszard Bolesław | Wałejko, Piotr | Witkowski, Stanisław

Data:2016.12.14 | 2016

Rodzaj zawartości:obrazy

Carbon-13 longitudinal relaxation time measurements and DFT-GIAO NMR computations for two ammonium ions of a tetraazamacrocyclic scorpiand system

Twórca:Nazarski, Ryszard Bolesław

Data:2014.02.06 | 2013

Rodzaj zawartości:obrazy

1JCH couplings in Group14/IVA tetramethyls from the gas-phase NMR and DFT structural study: a search for the best computational protocol

Twórca:Nazarski, Ryszard Bolesław | Makulski, Włodzimierz

Data:2014.06.06 | 2014.05.15

Rodzaj zawartości:obrazy

A Synoptic Approach to the Role of the Holy Spirit in the Conception of Jesus through Mary (Matt 1:18.25; Luke 1:35)

Twórca:Witkowski, Stanisław

Data:2020.06.18

Rodzaj zawartości:teksty

Zlota wolnosc koronna seymom y ziazdom na potomne czasy słuząca: z deklaracyą krotką [...] uczyniona przez Stanisława Witkowskiego [...]

Twórca:Witkowski Stanisław

Rodzaj zawartości:teksty

Czy mogę z tego skorzystać?:poproś o pozwolenie

Tożsamość Jezusa w kontekście Jego chrztu w Ewangeliach synoptycznych (Mt 3,13–17; Mk 1, 9–11; Łk 3, 21–22)

Twórca:Witkowski, Stanisław

Data:2021

Rodzaj zawartości:teksty

Wanda na szczęśliwe zwrocenie Iego Krolewskiey Miłośći z zwyćięstwa Moskiewskiego. Pod consultaciami Seymu walnego Warszawskiego, w Roku 1611. Dnia 26. Mieśiąca Września. Pisana przez Stanislawa Witkowskiego

Twórca:Witkowski Stanisław

Rodzaj zawartości:teksty

Czy mogę z tego skorzystać?:poproś o pozwolenie

Tokotrienole – mniej znana strona witaminy E

Twórca:Witkowski, Stanisław

Data:2016.12.20

Rodzaj zawartości:teksty

Federacja Bibliotek Cyfrowych

Szczegóły obiektu: Multi-conformer molecules in solutions: an NMR-based DFT/MP2 conformational study of two glucopyranosides of a vitamin E model compound

Opis

Podobne obiekty